针对光州女高中生杀人案件的调查不当疑云，警方与检方正在加快对当时调查方向受影响的警方指挥线的查明。警方对张允基的杀人案件和性侵犯案件的分离调查指示进行了调查，以确认国家调查总部的指示是如何传达的。

根据22日警方厅国家调查总部“张允基案件真相查明特别调查组”的消息，特搜组当天上午以参考人身份传唤了光州警察厅强力科长A警正进行调查。

特搜组正在调查A警正是否遵循了国家调查总部的指示，将张允基的女高中生杀人案件与外国女性性侵犯案件分开调查，并确认这一指示是如何通过光州警察厅和光山区警察署传达的。同时，调查还包括当时的报告与指挥体系，以及分离调查指示传达过程中的违法性。

通过搜查获得的A警正的手机也在分析中。特搜组正在检查与国家调查总部相关人员的通讯记录、通话记录，以及报告的撰写与传达过程，以确认整个调查指挥过程。

调查线也指向国家调查总部。特搜组正在分析在光州警察厅搜查过程中获得的A警正与国家调查总部强力科长B警正的工作相关对话记录，并据悉正在考虑传唤B警正进行调查，以确认分离调查指示是如何传达给光山区警察署的。

此次调查的重点是查明当时国家调查总部指挥部的介入情况。特搜组最近获得了国家调查总部一名高层向光州警察厅高层发送“这是本部长的指示”的信息的情况。

当时光山区警察署的调查小组提出应将张允基在杀人前两天实施的外国女性性侵犯案件与女高中生杀人案件合并调查，但这一意见未被采纳。前光山区警察署刑事科长方面表示，曾三次建议合并调查，但根据国家调查总部的指示，维持了分离调查。

检方也在加快对警方指挥线的调查。光州地检日前对国家调查总部强力犯罪调查科等进行了搜查，分析获得的警员手机等，同时对光山区警察署、光州警察厅及国家调查总部相关人员进行了调查。

目前，警方已立案的调查相关人员包括光山区警察署署长、刑事科长、调查组长及调查组成员等4人。特搜组与检方还在调查当时调查过程中强奸等杀人罪名的遗漏及证据的获取与管理过程。